Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Scarb2O35114 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Scarb2O35114 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Scarb2O35114 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scarb2O35114 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms