Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ArxO35085 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ArxO35085 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ArxO35085 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ArxO35085 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ArxO35085 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ArxO35085 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ArxO35085 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ArxO35085 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ArxO35085 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ArxO35085 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ArxO35085 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ArxO35085 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ArxO35085 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ArxO35085 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ArxO35085 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ArxO35085 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ArxO35085 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ArxO35085 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ArxO35085 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ArxO35085 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ArxO35085 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ArxO35085 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ArxO35085 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ArxO35085 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ArxO35085 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ArxO35085 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ArxO35085 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ArxO35085 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ArxO35085 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ArxO35085 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ArxO35085 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
ArxO35085 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ArxO35085 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ArxO35085 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ArxO35085 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ArxO35085 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ArxO35085 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ArxO35085 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ArxO35085 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ArxO35085 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ArxO35085 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ArxO35085 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ArxO35085 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ArxO35085 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ArxO35085 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ArxO35085 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ArxO35085 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ArxO35085 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ArxO35085 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ArxO35085 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ArxO35085 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ArxO35085 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ArxO35085 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ArxO35085 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ArxO35085 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ArxO35085 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ArxO35085 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ArxO35085 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ArxO35085 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ArxO35085 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ArxO35085 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ArxO35085 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ArxO35085 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ArxO35085 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ArxO35085 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ArxO35085 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ArxO35085 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ArxO35085 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ArxO35085 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ArxO35085 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ArxO35085 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ArxO35085 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ArxO35085 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ArxO35085 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ArxO35085 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ArxO35085 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ArxO35085 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ArxO35085 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ArxO35085 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ArxO35085 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ArxO35085 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ArxO35085 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ArxO35085 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ArxO35085 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ArxO35085 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ArxO35085 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ArxO35085 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ArxO35085 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ArxO35085 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ArxO35085 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ArxO35085 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ArxO35085 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ArxO35085 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ArxO35085 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ArxO35085 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ArxO35085 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ArxO35085 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ArxO35085 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ArxO35085 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms