Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casq1O09165 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casq1O09165 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casq1O09165 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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