Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps1O08983 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps1O08983 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hps1O08983 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hps1O08983 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hps1O08983 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hps1O08983 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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