Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
MsmbO08540 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
MsmbO08540 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MsmbO08540 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MsmbO08540 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
MsmbO08540 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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