Protein–RNA interactions for Protein: O08532

Cacna2d1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d1O08532 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d1O08532 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d1O08532 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d1O08532 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d1O08532 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d1O08532 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d1O08532 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d1O08532 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d1O08532 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d1O08532 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d1O08532 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d1O08532 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d1O08532 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d1O08532 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d1O08532 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d1O08532 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d1O08532 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d1O08532 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d1O08532 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d1O08532 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d1O08532 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d1O08532 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d1O08532 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d1O08532 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna2d1O08532 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms