Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp35M0QWN7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms