Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20939L7N243 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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