Protein–RNA interactions for Protein: K7N721

Gm3248, Predicted gene 3248, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3248K7N721 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3248K7N721 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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