Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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