Protein–RNA interactions for Protein: J3QNG1

Gm6408, Predicted gene 6408, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6408J3QNG1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.2 ms