Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17577J3QNF7 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms