Protein–RNA interactions for Protein: J3QMI4

Calhm3, Calcium homeostasis modulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm3J3QMI4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms