Protein–RNA interactions for Protein: J3QMB3

Fam240b, Family with sequence similarity 240 member B, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240bJ3QMB3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam240bJ3QMB3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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