Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms