Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm17535J3KMR8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm17535J3KMR8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm17535J3KMR8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm17535J3KMR8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm17535J3KMR8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm17535J3KMR8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm17535J3KMR8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm17535J3KMR8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Gm17535J3KMR8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm17535J3KMR8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm17535J3KMR8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm17535J3KMR8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm17535J3KMR8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms