Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms