Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Pabpc4lG5E8X2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pabpc4lG5E8X2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms