Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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