Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r39G3UWE6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r39G3UWE6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r39G3UWE6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r39G3UWE6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r39G3UWE6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r39G3UWE6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r39G3UWE6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r39G3UWE6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r39G3UWE6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r39G3UWE6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r39G3UWE6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r39G3UWE6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms