Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XntrpcF8VQM8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms