Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms