Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SmgcF6VRN1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SmgcF6VRN1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SmgcF6VRN1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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SmgcF6VRN1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SmgcF6VRN1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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SmgcF6VRN1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SmgcF6VRN1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms