Protein–RNA interactions for Protein: F6VLK5

Gm10722, Predicted gene 10722, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10722F6VLK5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10722F6VLK5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms