Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm10477F6SW83 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm10477F6SW83 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms