Protein–RNA interactions for Protein: F6SG70

Gm28374, Predicted gene 28374 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28374F6SG70 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm28374F6SG70 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm28374F6SG70 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm28374F6SG70 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm28374F6SG70 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm28374F6SG70 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm28374F6SG70 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm28374F6SG70 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm28374F6SG70 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm28374F6SG70 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm28374F6SG70 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Gm28374F6SG70 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm28374F6SG70 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Gm28374F6SG70 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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