Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms