Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Zfp558E9Q1J0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Zfp558E9Q1J0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Zfp558E9Q1J0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Zfp558E9Q1J0 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Zfp558E9Q1J0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Zfp558E9Q1J0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Zfp558E9Q1J0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Zfp558E9Q1J0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Zfp558E9Q1J0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Zfp558E9Q1J0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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