Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Vmn1r68E9Q0V3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r68E9Q0V3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r68E9Q0V3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r68E9Q0V3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r68E9Q0V3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r68E9Q0V3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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