Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc1E9Q043 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc1E9Q043 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms