Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms