Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms