Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms