Protein–RNA interactions for Protein: E9PVU2

4931429L15Rik, RIKEN cDNA 4931429L15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931429L15RikE9PVU2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4931429L15RikE9PVU2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
4931429L15RikE9PVU2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4931429L15RikE9PVU2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4931429L15RikE9PVU2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4931429L15RikE9PVU2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4931429L15RikE9PVU2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4931429L15RikE9PVU2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
4931429L15RikE9PVU2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
4931429L15RikE9PVU2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
4931429L15RikE9PVU2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
4931429L15RikE9PVU2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
4931429L15RikE9PVU2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931429L15RikE9PVU2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms