Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Soga1E1U8D0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms