Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC2

Gm28043, E3 ubiquitin-protein ligase RNF8, mousemouse

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28043E0CXC2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28043E0CXC2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28043E0CXC2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm28043E0CXC2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28043E0CXC2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28043E0CXC2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28043E0CXC2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28043E0CXC2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28043E0CXC2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28043E0CXC2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28043E0CXC2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28043E0CXC2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28043E0CXC2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28043E0CXC2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm28043E0CXC2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm28043E0CXC2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm28043E0CXC2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm28043E0CXC2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms