Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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