Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms