Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Catsperg2C6KI89 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Catsperg2C6KI89 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Catsperg2C6KI89 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Catsperg2C6KI89 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Catsperg2C6KI89 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Catsperg2C6KI89 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Catsperg2C6KI89 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Catsperg2C6KI89 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Catsperg2C6KI89 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Catsperg2C6KI89 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Catsperg2C6KI89 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Catsperg2C6KI89 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Catsperg2C6KI89 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Catsperg2C6KI89 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Catsperg2C6KI89 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Catsperg2C6KI89 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Catsperg2C6KI89 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Catsperg2C6KI89 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Catsperg2C6KI89 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms