Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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