Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms