Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rd3lB2RV38 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rd3lB2RV38 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rd3lB2RV38 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rd3lB2RV38 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rd3lB2RV38 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rd3lB2RV38 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rd3lB2RV38 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rd3lB2RV38 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rd3lB2RV38 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rd3lB2RV38 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rd3lB2RV38 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rd3lB2RV38 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rd3lB2RV38 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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