Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Abcc8B2RUS7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Abcc8B2RUS7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
Abcc8B2RUS7 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Abcc8B2RUS7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Abcc8B2RUS7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Abcc8B2RUS7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Abcc8B2RUS7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Abcc8B2RUS7 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Abcc8B2RUS7 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Abcc8B2RUS7 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Abcc8B2RUS7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Abcc8B2RUS7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Abcc8B2RUS7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Abcc8B2RUS7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Abcc8B2RUS7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Abcc8B2RUS7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Abcc8B2RUS7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Abcc8B2RUS7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Abcc8B2RUS7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Abcc8B2RUS7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Abcc8B2RUS7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Abcc8B2RUS7 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Abcc8B2RUS7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Abcc8B2RUS7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms