Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms