Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms