Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms