Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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Gm2012B1B0R1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Gm2012B1B0R1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Gm2012B1B0R1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms