Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb8B1AY40 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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