Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a6B1AVK5 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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