Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3173A6NAS3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms